Het College van de Algemene Rekenkamer wordt gevormd door drie leden, waarvan één de functie van president bekleedt. Momenteel is dat mr. H.E. Koning. In onderstaande tabel is een overzicht van de presidenten van de Rekenkamer opgenomen voorzover het de Algemene Rekenkamer betreft die in 1814 is opgericht. Het overzicht begint met het jaar 1841 omdat in de periode 1814 – 1841 de Rekenkamer geen vaste voorzitters of presidenten kende.

Voorzitters/presidenten van de Algemene Rekenkamer van 1841 tot heden.

Naam	Periode
Mr. A.R. de Wendt	1-12-1841	–	31- 7-1851
Jhr. M.B.H.W. Gevers	1-11-1851	–	1-10-1868
Jhr. O.W. Hora Siccama	12-10-1868	–	10-10-1879
Mr. T.W. baron van Zuylen van Nievelt	1- 1-1880	–	3- 7-1881
E.A.A.J. de Roy van Zuidewijn	26-10-1881	–	22-1-1892
E.W.J. baron Six van Oterleek	1- 4-1892	–	15-12-1901
C.M. van Vliet	17- 3-1902	–	11-11-1904
Jhr. mr. S.M.S. de Savornin Lohman	21- 1-1905	–	1- 7-1908
J.L. Le Bron de Vexela	1- 7-1908	–	26- 4-1911
Mr. Th.Ph. baron Mackay	19- 6-1911	–	1- 7-1920
Jhr. mr. J.H. van Reenen	1- 7-1920	–	1-10-1928
G.C. baron van Asbeck	8-10-1928	–	1- 1-1934
R. Zuyderhoff	1- 2-1934	–	1- 1-1945
Mr.dr. A.A. van Rhijn	Londen
Th. Sanders	2- 1-1946	–	31-12-1952
Drs. M. de Bloeme	16- 5-1953	–	31-12-1955
D.J. Gerritsen	1- 3-1956	–	11- 4-1956
L. Götzen	27-11-1956	–	31-12-1964
Mr. Ch.J.M. Hens	4- 1-1965	–	31-12-1967
Drs. H. Peschar	1- 2-1968	–	1-10-1984
F.G. Kordes	29-10-1984	–	1-11-1991
Mr. H.E. Koning	1-11-1991	–	01-05-1999
Drs. S.J. Stuiveling	01-05-1999	–	10-07-2015
Drs. A.P. Visser	10-07-2015	–

Bron: P.J. Margry, E.C. van Heukelom en A.J.R.M. Linders (red), Van Camere vander Rekeninghen tot Algemene Rekenkamer: Gedenkboek bij het 175-jarig bestaan van de Algemene Rekenkamer, ’s-Gravenhage, 1989, p. 518.

Zoals alle Hoge Colleges van Staat is ook de Algemene Rekenkamer een onafhankelijke instelling. Deze onafhankelijkheid komt onder meer tot uitdrukking in de benoemings- en ontslagprocedure van de leden die geregeld is in artikel 77 van de Grondwet. De leden van de Rekenkamer worden op voordracht van de Tweede Kamer voor het leven (tot 70 jaar) benoemd door de regering. Een lid kan alleen worden ontslagen wanneer hij of zij een strafbaar feit heeft gepleegd en door de rechter is veroordeeld. Dit betekent bijvoorbeeld dat de leden van de Rekenkamer bij het aantreden van een nieuw kabinet niet vervangen kunnen worden door „geestverwanten” van de nieuwe Regering. De onafhankelijkheid van de leden wordt verder gewaarborgd doordat zij bepaalde nevenfuncties niet mogen vervullen. Zij mogen bijvoorbeeld geen Kamerlid, minister of staatssecretaris zijn. Tenslotte is de Algemene Rekenkamer onafhankelijk in het uitvoeren van haar taken.

In onderstaande tabel 2 is een overzicht van de leden van de Rekenkamer opgenomen voorzover het de Algemene Rekenkamer betreft die in 1814 is opgericht.

Leden van de Algemene Rekenkamer van 1814 tot heden.

Naam	Periode
R. van den Bosch	1- 8-1814	–	25- 8-1823
G. van Bosvelt	1- 8-1814	–	14-11-1819
N. van Griensven	1- 8-1814	–	1- 1-1841
mr. G.J. Jacobson	1- 8-1814	–	28-11-1816
M. Piepers	1- 8-1814	–	13- 4-1815
mr. P.J. van der Goes	1- 8-1814	–	12- 9-1831
A.J.D. baron de Perponcher Sedlinitzki	1- 8-1814	–	15- 9-1822
mr. N. de Gijselaar	1- 8-1814	–	29- 1-1818
jhr. mr. L. Pauw geb. Hoeufft	1- 8-1814	–	17- 6-1824
A.F. de Virieu	1- 8-1814	–	5- 5-1838
mr. A.R. de Wendt	1- 8-1814	–	20-11-1841
mr. J.A.A. Zoutman	5- 8-1814	–	28- 3-1818
mr. J.A. Exrik	13- 4-1815	–	6- 8-1836
mr. J.H. Keiser	8- 8-1815	–	23- 3-1827
J.B. Picard (B)	24- 4-1818	–	31-12-1820
G. Ternois d’Henneveld (B)	24- 4-1818	–	31-12-1820
F. Bareel (B)	1- 1-1821	–	11-11-1830
mr. F.J. du Bus (B)	1- 1-1821	–	11-11-1830
A.J. graaf de Norman d’Audenhove (B)	1- 1-1821	–	11-11-1830
F. Papin (B)	1- 1-1821	–	6- 1-1830
C.J.B. Wouters de Terweerden (B)	1- 1-1821	–	11-11-1830
J.C.E. baron van Ertborn (B)	30-10-1821	–	1- 9-1823
jhr. M.B.H.W. Gevers	10-12-1822	–	6-11-1851
X. Willems (B)	8-12-1823	–	11-11-1830
J. d’Olislager (B)	8-12-1823	–	30- 6-1827
J.B. de Penaranda (B)	1-10-1824	–	11-11-1830
F.L.F. baron van Tuijll van
Serooskerken	1- 4-1825	–	24- 5-1831
mr. S.P. van Idsinga	19-11-1827	–	10-11-1853
J.J.A. van Willigen (B)	14- 1-1828	–	11-11-1830
mr. P. Bicker Caarten	31-12-1838	–	3-10-1839
J.P. van Mansvelt	18-11-1839	–	1-10-1855
jhr. O.W. Hora Siccama	4-10-1841	–	22-10-1868
G.S.G. baron van Fridagh	1-12-1841	–	1- 4-1866
C.H.T. baron Nahuijs	1-12-1841	–	8- 6-1870
H.L. Fievez	30-10-1851	–	2-12-1869
J.J. de Wetstein Pfister	2- 2-1854	–	16- 5-1879
mr. T.W. baron van Zuylen van Nievelt	31-12-1855	–	1- 1-1880
E.A.A.J. de Roy van Zuidewijn	5- 4-1866	–	20-10-1881
E.W.J. baron Six van Otterleek	26-10-1868	–	1- 4-1892
jhr. mr. H.P. van Karnebeek	10- 3-1870	–	10-10-1879
W.A. van Rees	21- 7-1870	–	13-10-1896
C.M. van Vliet	30- 6-1879	–	17- 3-1902
J.L. Becking	18-12-1879	–	1- 4-1911
jhr. mr. S.M.S. de Savornin Lohman	18-12-1879	–	21- 1-1905
jhr. mr. J.A. Sandberg	20-10-1881	–	30-11-1901
J.L. le Bron de Vexela	1- 4-1892	–	1- 7-1908
mr. Th.Ph. baron Mackay	2- 1-1897	–	19- 6-1911
jhr. mr. J.H. van Reenen	3- 1-1902	–	1- 7-1920
M. de Ras	17- 3-1902	–	4- 5-1920
mr. G.J. Goekoop	2- 1-1905	–	7-10-1911
G.C. baron van Asbeck	1- 7-1980	–	8-10-1928
ir. J. Krap	13- 4-1911	–	25- 4-1933
A.J.M. Strumpff jr.	19- 6-1911	–	4- 8-1930
C.F. Rechlien Morra	18-12-1911	–	25- 3-1912
R. Zuyderhoff	22- 7-1912	–	1- 2-1934
jhr. G.A.A. Alting von Geusau	28- 6-1920	–	31-12-1934
dr. W.C.A. baron van Vredenburch	1- 7-1920	–	31-12-1936
Th. Sanders	26-10-1936	–	1- 1-1946
D.O. Norel	31-12-1937	–	4- 3-1941
dr. O. Bakker	1- 9-1941	–	18- 1-1955
drs. M. de Bloeme	1- 7-1946	–	16- 5-1953
L. van der Tempel	1- 4-1953	–	1- 7-1961
mr. C.J.M. Hens	26- 4-1955	–	4- 1-1965
mr. J.L.H. Vossenaar	2- 1-1962	–	1- 1-1969
A. Hansen RA	4- 1-1965	–	1- 7-1981
J. Boom	5- 1-1970	–	1- 8-1977
dr. W. Drees jr.	4-10-1977	–	1- 1-1984
F.G. Kordes	1- 8-1981	–	29-10-1984
H.H.G. Koolen RA	1- 1-1984	–	1-10-1990
mw. drs. S.J. Stuiveling	29-10-1984	–	heden
drs. M.B. Engwirda	1-10-1990	–	1- 1-1996
mr. dr. A.J.E. Havermans	1- 8-1996	–	heden

Bron: P.J. Margry, E.C. van Heukelom en A.J.R.M. Linders (red), Van Camere vander Rekeninghen tot Algemene Rekenkamer: Gedenkboek bij het 175-jarig bestaan van de Algemene Rekenkamer, ’s-Gravenhage, 1989, pp. 519-520.

In tabel 3 is een overzicht van de plaatsvervangende leden van de Rekenkamer opgenomen voorzover het de Algemene Rekenkamer betreft die in 1814 is opgericht.

Tabel 3. Plaatsvervangende leden van de Algemene Rekenkamer van 1814 tot heden.

Naam	Periode
D.O. Norel	1- 5-1934	–	31-12-1937
Th.Sanders	1- 5-1934	–	26-10-1936
dr. O. Bakker	27- 2-1937	–	1- 9-1941
mr. dr. M.J.A.V. Kocken	16- 7-1938	–	1- 1-1956
mr. J.J. van Walsum	8- 7-1946	–	1- 1-1957
Th.R. Deelder	2- 7-1956	–	1- 1-1973
mr. J.L.H. Vossenaar	18- 4-1956	–	2- 1-1962
mr. G.W. Toebes	2- 7-1962	–	1- 1-1976
dr. C.H. Eilbers RA	7- 3-1973	–	1- 1-1988
C.J.F.W. Hafkemeijer	4- 3-1976	–	1- 1-1985
J.Boom	4-10-1977	–	1- 1-1982
mw. E.J. Sevenhuijsen-Hoogewooning	31- 3-1982	–	1- 8-1994
G.M. Kersten B.ec	21- 5-1985	–	heden
drs. B.A. van Nes RA	16- 3-1988	–	heden

Bron: P.J. Margry, E.C. van Heukelom en A.J.R.M. Linders (red), Van Camere vander Rekeninghen tot Algemene Rekenkamer: Gedenkboek bij het 175-jarig bestaan van de Algemene Rekenkamer, ’s-Gravenhage, 1989, pp. 520-521.

De leden van de Algemene Rekenkamer beschikken over een eigen ambtelijk apparaat zodat zij niet afhankelijk zijn van de ambtenaren van de verschillende ministeries. Aan het hoofd van dit apparaat dat in 1994 een omvang had van 337 personen, staat de secretaris die samen met de hoofden van de onderzoeksdirecties het Managementteam vormt. In de periode 1969 – 1990 is het aantal medewerkers gegroeid van 198 naar 337 (bron: Jaarverslagen 1970, 1980, 1990).

In tabel 4 is een overzicht van de secretarissen van de Rekenkamer opgenomen voorzover het de Algemene Rekenkamer betreft die in 1814 is opgericht.

Tabel 4. Secretarissen van de Algemene Rekenkamer van 1814 tot heden.

Naam	Periode
mr. J.A. Exrik	1- 8-1814	–	13- 4-1815
S. Dassevael	27- 9-1815	–	16- 1-1838
J.A. de Visch Eijbergen	1- 5-1838	–	26-10-1853
D.P. van Hoogenhuyze	29-12-1853	–	8-10-1857
J.G. Spanjaard	1- 1-1858	–	31-12-1872
jhr. S.M.S. de Savornin Lohman	6- 1-1873	–	18-12-1879
jhr. mr. J.H. van Reenen	26- 1-1880	–	3- 1-1902
G.C. baron van Asbeck	8- 2-1902	–	1- 7-1908
C.F. Rechlien Morra	24- 7-1908	–	18-12-1911
A. Ossewaarde	14- 2-1912	–	1- 5-1926
H.F.C. Berckenkamp	17- 5-1926	–	1-12-1942
G.J. Tinbergen
(als waarnemend secretaris)	1-12-1942	–	18-10-1945
(als secretaris)	18-10-1945	–	1- 5-1946
L. van der Tempel	1- 7-1946	–	1- 4-1953
mr. C.J.M. Hens	12- 5-1953	–	26- 4-1955
J.Oomen	23- 5-1955	–	1-10-1963
A. Hansen RA	1-10-1963	–	4- 1-1965
J.Boom	1- 2-1965	–	5- 1-1970
drs. H. Munnikes RA	2- 2-1970	–	1- 6-1982
P.J. Visser	3- 6-1982	–	1- 4-1986
drs. W. van der Zanden	11- 4-1986	–	1- 8- 1994
dr. mr. T.A.M. Witteveen	1-11-1994	–	heden

Bron: P.J. Margry, E.C. van Heukelom en A.J.R.M. Linders (red), Van Camere vander Rekeninghen tot Algemene Rekenkamer: gedenkboek bij het 175-jarig bestaan van de Algemene Rekenkamer, ’s-Gravenhage, 1989, p. 521.

Er zijn drie onderzoeksdirecties en één directie ondersteuning. De onderzoeksdirecties bestaan uit vier tot vijf departementale onderzoeksbureaus en een rijksbreed bureau. De departementale onderzoeksbureaus controleren één departement en zijn ook op dit departement gehuisvest. De bureaus variëren in grootte van ongeveer 15 tot 25 personen. De drie rijksbrede bureaus hebben ieder een speciale coördinerende en ontwikkelingstaak gekregen ten aanzien van het rechtmatigheidsonderzoek, het doelmatigheidsonderzoek en het onderzoek naar organen buiten het Rijk. Bij de drie onderzoeksdirecties werken ongeveer 250 personen.

De directie Ondersteuning bestaat uit de afdelingen Beleidsontwikkeling, Redactie en Voorlichting, Bestuurlijk-Juridische Zaken, Personeelsmanagement en Interne Dienstverlening.

In het centrale pand aan het Lange Voorhout in ’s-Gravenhage zetelt het College met de ambtelijke top, de directie Ondersteuning en de rijksbrede bureaus.

Bij de Rekenkamer werken hoofdzakelijk academici en HBO’ers met als studierichtingen rechten, accountancy of één van de sociale wetenschappen als de bestuurskunde of economie.